Tek maç eleme usulüne göre oynanan 2. turda 66 takım mücadele etti. Maçlarını kazanan takımlar, adını bir üst tura yazdırdı.
İkinci turda alınan sonuçlar ve tur atlayan takımlar şöyle:
10 Eylül Salı:
Kars 36 Spor-Pazarspor: 3-4
Yeni Orduspor-Fatsa Belediyespor: 0-2
Kemerspor 2003-Karaman Belediyespor: 2-0
1877 Alemdağspor-Çatalcaspor: 2-0
Kocaelispor-Gölcükspor: 3-1
İçel İdmanyurdu-Serik Belediyespor: 1-0
11 Eylül Çarşamba:
Ağrı 1970-Artvin Hopaspor: 3-3 (4-2 Penaltılarla)
1954 Kelkit Belediyespor-Ofspor: 1-0
Görelespor-Yomraspor: 3-0
Malatya Yeşilyurt Belediyespor-Elazığ Belediyespor: 0-5
Cizrespor-Diyarbekirspor: 1-1 (5-6 Penaltılarla)
Karbel Karaköprü Belediyespor-Siirt İl Özel İdare: 1-2
Medical Park Batman Petrolspor-Mardin Büyükşehir Başakspor: 1-3
1074 Çankırıspor-Kastamonu Özel İdare Köy Hizmetleri: 5-2
Çankaya-Kırıkkale Büyük Anadoluspor: 1-4
Altındağ Belediyespor-Yozgatspor 1959: 1-2
Tokatspor-Erbaaspor: 0-2
Erzinspor-Kilis Belediyespor: 3-1
Nevşehir Belediyespor-Osmaniyespor: 0-1
Kozanspor-Payasspor: 0-3
Silivrispor-Bursa Yıldırımspor: 2-0
Maltepespor-Esenler Erokspor: 1-3
Şile Yıldızspor-Karacabey Belediyespor: 1-2
Bayrampaşa-Bigaspor: 4-1
Düzcespor-Darıca Gençlerbirliği: 0-2
Manisaspor-Turgutluspor: 1-2
Büyükçekmece Tepecikspor-Halide Edip Adıvar Spor: 1-0
TKİ Tavşanlı Linyitspor-Somaspor: 0-1
Ci Group Buca-Nazilli Belediyespor: 2-2 (3-5 Penaltılarla)
Fethiyespor-Kızılcabölükspor: 3-2
12 Eylül Perşembe
Anagold 24 Erzincanspor-Muş Menderesspor: 3-1
Sultanbeyli Belediyespor-Edirnespor: 0-1
Karşıyaka-Muğlaspor: 0-0 (2-4 Penaltılarla)
Karşılaşmaları kazanan takımlar tur atladı.